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計算構造生物学研究室 Home 研究実績 メンバー紹介 日常 計算構造生物学研究室 Structual Biology + Computer Science コンピューターテクノロジーを活用し、生命活動の謎に挑む 近年、科学技術の進歩に伴って、多くの生命現象が解明されてきました。 しかしながら、未だに解明されていない現象も多くあります。 特に、実際に観察を行うことが困難な現象に関しては 、その解明がなされていないことも多くあります。 そこで、当研究室では、そのような解明が困難な現象に対して、計算科学的アプローチを駆使して、 その機構を解明しようと日々研究活動を行っています。 研究内容 水和ダイナミクス 生体内における水、及びそれに関連した物質の働きは、生命を維持し、活動するために重要な役割を担っています。 実際に、水分子の原子レベルでの活動となると、実際に観察を行うことが極めて難しく、 不明確な部分が多くあります。 そこで、当研究室では、オリジナルのシミュレーションソフトウェアを開発し、それら水分子及び関連する物質の動きをコンピュータ上で再現し、その作用構造の解明を目標に、研究活動を行っています。 タンパク質間相互作用 生体内におけるタンパク質の働きは、その生命活動の中枢を担っていると言っても相違無い程、 重要な役割を担っています。しかしながら、実際に観察できないほど小さい、あるいは構造的に貧弱なタンパク質は、その観察が難しいとされています。 そこで、当研究室では、コンピュータ上でタンパク質を仮想的に再現し、実際に観察できない働きをシミュレートしています。そこから得られた知見をもとに創薬分野にも手を伸ばして研究を行っています。 機械学習 近年、AI関連の技術が急激な勢いで発達しつつあり、今後もさらに発展してくことが考えられています。 そして、情報科学以外にも活用する試みが盛んに行われています。 当研究室においても例外ではなく、情報科学における人工知能技術の一つである機械学習を用いて、 タンパク質及びその付随した分子の働きを解析しています。 また、その技術を用いて、AIによる創薬に関しても研究活動を行っています。 研究実績 メンバー紹介 日常 研究室からのお知らせ 2021 6/16~18 第21回日本蛋白質科学会年会＠オンライン M1からM2まで計8人の学生がポスター発表を行い、活発な議論を行いました。 2020 11/16 当研究室の笠原が執筆を担当した本が発売されました！！ 笠原が第Ⅵ部78章の粗視化分子動力学法p.383~387を担当した白木賢太郎編『相分離生物学の全貌（現代化学増刊46)』が発売されました！！ URL 2020 2/11 合同卒論発表会＠立命館大学 菊池研と髙橋研の総勢21名の学部生が研究の発表をしました。 他の研究室の教授や生徒から質問をいただき、議論を通して自分の研究について深めることが出来る機会となりました。 2019 9/24~26 第57回日本生物物理学会年会＠宮崎県・シーガイア　コンベンションセンター B4からM2まで計6人の学生がポスター発表を行い、活発な議論を行いました。 寺澤が「液―液相分離における荷電性残基の影響に関する分子動力学シミュレーション」というテーマで学生発表賞を受賞しました。 2019 8/29~30 イノベーション・ジャパン2019＠東京ビックサイト　青海展示棟　Ｂホール 「動く蛋白質の形が分かる　‐　理論創薬のためのシミュレーション技術」という内容でポスターセッションをしました。 様々な業種の方に本研究室の技術を紹介し、社会に直結した貴重なお話を伺うことが出来ました。 2019 6/24~26 第19回日本蛋白質科学会＠神戸国際会議場 第19回日本蛋白質科学会に参加しました。 ポスター発表を通して活発な議論を行い、今後の研究に活かせる経験を積むことが出来ました。 2019 4/3 LLPS学会＠産業総合研究所臨海副都心センター 寺澤と笠原がLLPS学会に参加。笠原が以下の演題で発表。 「蛋白質天然変性領域と相分離現象の分子機構解明に向けた分子シミュレーション技術の開発」 2018 9/15~9/17 日本生物物理学会＠岡山大学 第56回 日本生物物理学会年会に参加しました。学生にとっては初めての学会発表となりましたが よく頑張っていました。また、積極的に他大学or研究機関の方々とディスカッションを行い、自身の見識を深めました。 2018 6/26~6/28 日本タンパク質学会年会＠朱鷺メッセ（新潟） 第18回 日本タンパク質学会に参加しました。ポスター発表を通して多くの方と議論することができていました。 日頃の研究成果を十分に発揮できたと感じています。 2018 4/24 当研究室の笠原が生命科学部学部長賞を受賞されました！！ 笠原はがんや自己免疫疾患において重要なタンパク質Ets1が持つ天然変性領域について、リン酸化が遺伝子発現制御を行うメカニズムを、分子シミュレーションによって明らかにしました。過去2年間で、国際論文12報（うち筆頭著者7報、責任著者7報）、著書1冊（チャプターひとつを担当）、国際学会2件、国内学会32件の研究発表を行い、HPCI利用研究課題優秀成果賞を受賞しました。これらの成果が認められ、今回の受賞となりました。おめでとうございます！ 計算構造生物学研究室（高橋研） 見学・訪問、いつでも大歓迎です！！ お気軽にご連絡下さい！！ 連絡先:077-561-5077 内線：4413（研究室） 4404（高橋教授 個人研究室） 住所 ：滋賀県草津市 野路東1-1-1 バイオリンク４階 4C E-mail ：tkhs▲sk.ritsumei.ac.jp （高橋教授）            ：ktkshr▲fc.ritsumei.ac.jp （笠原助教） 管理人：sj0052er▲ed.ritsumei.ac.jp (佐藤) sj0045vr▲ed.ritsumei.ac.jp (寺澤) （▲を＠に変更して下さい）